為全面加強和夯實藥品監管體系機制，建立一支強有力的職業化專業化藥品監管隊伍，市委市政府批準市藥監局成立5個直屬分局。2020年11月30日，市藥監局直屬第一分局、第二分局、第三分局、第四分局、第五分局成立暨揭牌儀式分別在朝陽、海淀、亦莊、昌平、順義的辦公場所舉行。儀式以分會場視頻連線方式舉行。副市長王紅同志、市市場監管局黨組書記、局長冀巖出席，市藥監局黨組書記于海波主持。
5個直屬分局于12月1日起正式履職，負責轄區內的藥品、醫療器械和化妝品生產監管，以及藥品批發、零售連鎖總部，藥品醫療器械網絡交易服務第三方平臺和化妝品電子商務平臺經營者監管等工作。第一分局管轄范圍為東城區、西城區、朝陽區；第二分局管轄范圍為海淀區、豐臺區、石景山區、門頭溝區；第三分局管轄范圍為房山區、通州區、大興區、北京經濟技術開發區；第四分局管轄范圍為昌平區、懷柔區、延慶區；第五分局管轄范圍為順義區（含北京天竺綜合保稅區）、平谷區、密云區。
成立會上，市藥監局局長吳彬同志表示市藥監局直屬分局的成立，標志著我市深化藥品監管體制改革取得重要成果，也標志著首都藥品監管體系建設更加完備、市區協同監管網更加嚴密、全市藥品安全防線更加牢固。5個藥監直屬分局將堅持“四個最嚴”，依法高效履職，筑牢藥品安全的銅墻鐵壁；將加強工作融合，團結一切力量，凝聚強大的監管合力；將增強服務意識，優化營商環境，助力醫藥產業高質量發展。市市場監管局黨組書記、局長冀巖同志指出市藥監局直屬分局的成立，是深化監管體制機制改革的一件大事，要求全市各級藥品監管部門秉持鮮明法治精神、真摯的為民情懷和政治方向，守好一方平安，促進一方發展，建強一支隊伍。市政府副市長王紅同志高度肯定市藥監局工作，在統籌疫情防控和經濟社會發展貢獻了重要力量。她強調，全市藥品監管部門一要提高政治站位，承擔責任和使命；二是統籌兼顧，服務大局，做首都高質量發展的先行者；三是加強領導，深化改革，做落實管黨治黨的踐行者。以忠誠干凈擔當的實際行動，推動新時代首都醫藥健康產業高質量發展。
市藥監局直屬分局的成立標志著我市藥品監管體系能力建設朝著科學化、現代化軌道又邁出關鍵一步，對于夯實我市藥品監管基礎、提高藥品安全及高質量發展水平，具有重要意義和推動作用。